Hola Ana:
Una pregunta, ¿las mismas facturas que están en la tabla GVA53 están en la tabla GVA12? Porque habría que ver si el campo con que se quiere unir coincide en tipo de dato y contenido.
Algo importante que hay que recordar que las relaciones no se comportan del mismo modo en SQL que en Power BI. En PBI no funcionan igual las tablas intermedias. Lo ideal sería que solo existiera una tabal de hechos con todos los datos de las facturas, para ello puedes crear desde SQL una vista con toda estructura. Otra opción es crear esa tabla desde el editor de consultas de PBI utilizando la función de Merge.
Espero te sea de utilidad.
Saludos 